Mercredi, c'est fini !

Last day.

Déjeûner d'adieu avec les filles du labo, en terrasse, à Soleil, un restau Canadien-Français sur Westwood boulevard. On se souviendra surtout des desserts. On partage une crêpe roulée (glace vanille, sauce chocolat, chantilly et fraises), une tarte tatin et un feuilleté aux fraises. Les

photos sont sur l'appareil de Victor et j'ai oublié de les copier, donc il vous les montrera directement.

Après, on cherche une idée de cadeau pour Michèle, dont c'est l'anniversaire demain. Je suggère de faire un tour chez Victoria's Secret, mais les filles du labo sont absolument horrifiées que je puisse ne serait-ce que suggérer à Victor d'acheter de la lingerie affriolante pour sa mère. Moi, ça me paraissait une bonne idée. Bon, faudra trouver autre chose.

Je file chez le coiffeur, et je reviens juste à temps pour voir les résultats finaux du projet. Il est temps que je vous explique. Ci-dessous, une coupe transverse de coeur d'embryon de souris à 11 jours et demie de gestation, colorée en rose à l'éosine (cytoplasme de toutes les cellules) et en bleu avec un substrat de la beta galactosidase, qui marque les cellules d'un tissu particulier, le système de conduction cardiaque. Après des mois à analyser des centaines de coupes, on a trouvé des différences entre les sauvages et nos mutants, qui ont donc une anomalie du dévelopement de ce tissu (ce qui leur donne des anomalies du rythme cardiaque et pourrait expliquer pourquoi ils meurent in utero). Comme vous voyez, le bleu, il y en a un peu partout. C'est pas facile de visualiser sur tout le coeur le profil d'expression, et encore moins les différences entre deux coupes.

Le projet de Victor, c'est de faire une reconstitution en 3D du coeur et du marquage, dans une paire mutant/sauvage. Il a donc fallu mettre les coeurs en block de paraffine, faire les coupes fines (10 microns) au microtome, colorer à l'éosine, monter les lames. Puis photographier chaque coupe (70-80 par coeur) à la loupe binoculaire. Après on passe dans un programme magique sur l'ordinateur qui permet d'empiler le tas de photos. Il faut ensuite aligner chaque image à la suivante le mieux possible (l'une se met sur l'autre en transparence, et on déplace, tourne etc. jusqu'à ce que ça s'aligne). 

L'étape suivante, qui prend le plus de temps et demande le plus de finesse, est le marquage des tissus. Pour ce projet, on a marqué en orange tout ce qui est coeur (pour avoir une forme de référence) et en bleu tout ce qui est bleu (les données qui nous intéressent). Donc, sur chaque photo, il faut tracer à la souris le coutour de toutes les parties du coeur et le contour de tout le système de conduction. Ca paraît simple comme ça, mais c'est vraiment très difficile parce ce qu'il faut que ca corresponde bien d'une image à l'autre. Voilà à quoi ça ressemble (l'image n'est pas de Victor parce qu'on a pas eu le temps de faire de capture d'écran pour ça).

Enfin, quand tout cela est fait, on secoue très fort, on triangule à mort, on lisse tant qu'on peut et... on obtient des modèles en trois dimensions. On peut alors rendre un des tissus transparents pour mieux révéler l'autre. 

On peut même faire des petits films. Super. Mais que ça fait quatre fois que j'essaye d'uploader sur  le blog et que j'y arrive pas. Que ça m'énerve. 

Bref, c'est très beau, et même utile ! On est très fier. La dernière tentative d'enseigner ce logiciel à quelqu'un s'était soldée par trois mois de perdus, un seul modèle à la fin, qui était à l'envers... 

On récupère le doudou à l'école et on fonce à Santa Monica. Dernier coucou à l'océan - il fait très bleu et chaud aujourd'hui. Une petite balade sympa, et en plus, on trouve le cadeau pour Michèle. On rentre et c'est piscine jusqu'à la dernière limite - il fait presque nuit quand on arrive à les arracher de l'eau une demi-heure avant le départ. 

Une dernière flamiche pour Vico et en route. Eric l'emmène seul - je reste mettre 'Turo au lit et préparer la chambre d'amis avant l'arrivée d'une copine française demain. Voilà, il a enregistré ses bagages et passé la police... on a fait notre boulot. On espère qu'il arrivera entier à l'autre bout et qu'il gardera de bons souvenirs de son séjour chez nous.

Voilà, j'ai fini mon boulot. Ça va me manquer, le blog et le grand frère d'Arthur.